O jogo é fixado no ano 2067, quando os recursos da Terra estão quase todos esgotados. Para evitar a lenta decadência da civilização, as grandes corporações da Terra volte para as estrelas – uma área do espaço conhecido como “A Fronteira” – para encontrar as matérias-primas que tão desesperadamente necessitam.
Infelizmente, alguns antigos “amigos” já estavam no bairro, quando as empresas chegaram … os poderes da “primeira guerra alienígena” de 1999, – e eles têm dos seus próprios planos para os recursos da Frontier. Planos que poderia muito bem significar o fim da raça humana.
Em X-COM Interceptor, o jogador assume comando da força de elite que foi criada para lutar contra os extraterrestres no espaço. Ao contrário de jogos anteriores da série, o jogo é basicamente um simulador espacial combater, com o jogador starfighters voar para proteger os humanos corporações criado para reunir recursos para a Frontier. O jogador também atua no papel do X-COM comandante da região, a gestão de bases de recursos, bem como a capacidade financeira da organização. O jogador também precisa de captura e investigação tecnológica estrangeiro a fim de melhorar a tecnologia humana e descobrir a razão para o estrangeiro o interesse na região [1].
X-Com Interceptor, embora lançado como o quarto jogo, foi realmente definida antes de X-COM: Apocalypse, tornando assim o terceiro jogo da ordem cronológica.
