Em Made in Abyss: Binary Star Falling into Darkness, o jogador descerá ao mundo do Abyss e evoluirá através de sua experiência em suas profundezas. O jogador poderá reviver a experiência do anime no modo história, além de explorar uma história original supervisionada pelo próprio autor da série, Akihito Tsukushi. A história original se passará muitos dias após Riko e Reg partirem para o Abyss.