ZX Advent é o segundo título da série ZX e começa exatamente quatro anos e oito meses após os últimos acontecimentos do primeiro jogo. Os personagens mudam com relação aos de Mega Man ZX. Apesar de todos os acontecimentos jogáveis dos dois personagens serem idênticos, a história de cada um deles é diferente, o que leva os jogadores a terminarem com ambos os personagens apenas para compreender o enredo por inteiro.