Em um brilhante encontro, Professor Layton vs. Ace Attorney vai reunir duas das mais populares figuras da lei do mundo dos jogos para resolverem juntos um caso. Falando um pouco a respeito do processo de desenvolvimento, Akihiro Hino da Level 5 disse que devido a diferenças entre ambos os estúdios e suas culturas, levou algum tempo para que ele e o produtor de Ace Attorney, Shu Takumi literalmente "confiassem" um no outro:
"Levou certo tempo até que nós tivéssemos a tranquilidade necessária para garantir que confiávamos totalmente um no outro. Haviam algumas vezes durante o processo de desenvolvimento que não sabíamos exatamente o que fazer e não podíamos nos reunir para debater, então eu geralmente dizia: "Porque não fazemos do jeito que Takumi gostaria que fosse?" de forma a facilitar o trabalho dele."
Exclusivamente para o Nintendo 3DS, o título combina o que existe de melhor da consagrada série de jogos Ace Attorney com a investigação presente em Professor Layton, os personagens vão se ver envolvidos em um caso envolvendo uma suposta praticamente de bruxaria, para mais tarde descobrir que tudo aquilo faz parte de uma trama muito maior, tendo que unir as forças para desvendar quem esta realmente por trás dos acontecimentos, contando é claro com a sua ajuda.