O jogo antecessor, foi lançado em duas versões diferentes do Japão chamado Inazuma Eleven Go Dark & Inazuma Eleven GO Shine. Com o novo lançamento anunciado para o Japão também será usada o mesmo modelo. Inazuma Eleven GO 2 Chrono Stone dividrá em duas versões distintas intitulado Inazuma Eleven GO 2 Chrono Stone Nepuu GO e Inazuma Eleven GO 2 Chrono Stone Raimei.
A versão japonesa foi anunciado para o inverno deste ano. Mesmo sem especificar qualquer data, confirmou que sua plataforma será a Nintendo 3DS.