As primeiras informações sobre a versão para Wii de Fifa 2009 dão conta de que a EA andou observando os controles de PES"08. Ao que parece, a empresa irá incluir a mesma opção de jogabilidade com o ponteiro além de outras formas (opcionais) de jogo, uma delas tendo o passe de bola sendo feito automaticamente.
Além disso, haverá um "Footii Mode", no qual 8 Miis em cada time podem competir em um jogo no estilo Arcade.