Super Mario Strikers conta com cinco modos de jogo. O primeiro é Grudge Match, o modo de exibição que pode ser jogado por até 4 jogadores. No Cup Battle, o jogador forma seu time para enfrentar o computador e ganhar o troféu de cada copa. O terceiro é o Super Cup Battle, que é liberado após ganhar todos os troféus da Cup Battle. O quarto modo é o Custom Battle, que permite customizar suas próprias partidas e torneios. E por último o Strikers 101 tutorial, onde os iniciantes podem aprender as regras básicas e avançadas, como poderes e habilidades, do jogo.
